वे सिलहट में शाहजलाल विज्ञान एवं प्रौद्योगिकी विश्वविद्यालय में आयोजित एक कार्यक्रम में शामिल होने गए थे। एक मीडिया रिपोर्ट के अनुसार- प्रो. इकबाल युनिवर्सिटी के निमंत्रण पर वहां गए थे। तभी शाम को परिसर में मुक्ता मंच पर एक व्यक्ति ने तेजधार हथियार से उनके सिर पर वार कर दिया। इसके बाद परिसर में अफरातफरी मच गई। वहां मौजूद लोगों ने हमलावर को पकड़ लिया और जमकर उसकी पिटाई की। हमलावर की अभी तक पहचान नहीं हो पाई है न ही हमले का मकसद पता चला है। बाद में आरोपी को पुलिस के हवाले कर दिया गया।
मेट्रोपॉलिटन पुलिस कमिश्नर गुलाम किब्रिया के अनुसार- हमलावर की हालत अभी ठीक नहीं है। इलाज के लिए उसे भी अस्पताल में भर्ती कराया गया है। उसके स्वस्थ होने पर ही आगे की पूछताछ की जाएगी। कुछ छात्रों का मानना है कि इस हमले के पीछे आतंकियों का हाथ है। बता दें, इकबाल को 2015 से ही पुलिस सुरक्षा मिली हुई थी। आतंकियों ने उन्हें जान से मारने की धमकी दी हुई थी। बता दें, मोहम्मद जफर इकबाल साइंस फिक्शन के लिए जाने जाते हैं।