अंतिम दौर में सुनवाई कुल 49 में से 22 अभियुक्तों पर सुनवाई लखनऊ की स्पेशल सीबीआई कोर्ट (Special CBI Coart) में अंतिम दौर में है। वहीं 8 अभियुक्तों पर रायबरेली में मुकदमे चल रहे हैं। 9 ऐसे भी अभियुक्त हैं, जिन पर कहीं मुकदमा चल ही नही रहा है। इस बीच 10 अभियुक्तों और लगभग 50 गवाहों की मौत भी हो चुकी है। अभियुक्तों में कुछ मुख्यमंत्री और कैबिनेट मंत्री भी रह चुके हैं।
बाबरी मस्जिद विध्वंस केस में नामजद 6 दिसंबर 1992 को विवादित राम जन्मभूमि-बाबरी मस्जिद इमारत को तोड़ने के कथित षड्यंत्र, भडकाऊ भाषण केस में अशोक सिंघल, गिरिराज किशोर, लालकृष्ण आडवाणी, मुरली मनोहर जोशी, विष्णु हरि डालमिया, विनय कटियार, उमा भारती और साध्वी ऋतंभरा नामजद अभियुक्त हैं। भारतीय दंड संहिता (आईपीसी) की धारा 153ए, 153बी, 505, 147 और 149 के तहत यह मुकदमा रायबरेली में चल रहा है। इनमें अब तक 40 गवाह पेश हुए हैं। इसी मुकदमे के आधार पर पुलिस ने 8 दिसंबर 1992 को आडवाणी और अन्य नेताओं को गिरफ्तार किया था। शांति व्यवस्था की दृष्टि से इन्हें ललितपुर में माताटीला बांध के गेस्ट हॉउस में रखा गया था।
केस सीबीआई को ट्रांसफर सभी एफआईआर में से केस नंबर 197 और केस नंबर 198 सबसे अहम था। तत्कालीन सरकार ने केस नंबर 197 की जांच सीबीआई को सौंप दी, जबकि केस नंबर 198 की जांच यूपी पुलिस की सीबी और सीआईडी विंग को सौंपी गई। वहीं 27 अगस्त 1993 में यूपी सरकार ने बाकी सभी केस सीबीआई को सौंप दिए। सीबीआई ने इन सभी केस की जांच की। जिसमें बाबरी मस्जिद विध्वंस केस (Babri Masjid Demolition Case) का मामला भी शामिल था। इसके बाद सीबीआई ने 5 अक्टूबर 1993 को लखनऊ के स्पेशल कोर्ट में 40 लोगों के खिलाफ चार्ज शीट दाखिल की। इसके करीब 2 साल बाद 11 जनवरी 1996 को सीबीआई ने एक और सप्लीमेंट्री चार्जशीट फाइल की। इसमें 9 वीआईपी लोगों को नाम था। इस तरह कुल आरोपियों की संख्या 49 हो गई।