मंदिर निर्माण से पूर्व रामजन्मभूमि तीर्थ क्षेत्र ट्रस्ट लगातार अपने सभी कागजी कार्य को पूरा करते हुए पहले ट्रस्ट ने खाते को सार्वजनिक किया उसके बाद मंदिर का लोगो भी जारी कर दिया है। इस लोगों को किसी एक्सपर्ट द्वारा नहीं बल्कि स्थानीय कार्यकर्ताओं के द्वारा बनाया गया है जिसमें सूर्यवंशी प्रतीक के साथ भगवान राम व उनके भक्त हनुमान जी को अंकित किया गया है इसके साथ ही लोगों में नीचे राम विग्रहवान धर्म: भी अंकित है। जिसके कारण यह लोगो विवादों में आ गया। काशी के विद्ववानों ने ट्रस्ट के इस लोगो का विरोध किया यह आपत्ति लोगो मे लिखे श्लोक में हलंत का मात्रा न होने से किया तो वहीं ट्रस्ट ने दूसरा लोगों जारी करते हुए भूल की बात कही।