इंदौर स्टेशन से यह तीसरी विशेष श्रेणी की ट्रेन शुरू होने जा रही है। अभी तक इंदौर से दुरंतो और हमसफर जैसी ट्रेन का संचालन ही किया जा रहा था, अब महामना श्रेणी की ट्रेन भी चलेगी। इस ट्रेन में कई विशेष सुविधाएं हैं। स्टेशन आने से पहले जीपीएस सिस्टम द्वारा स्टेशन का नाम और दूरी दोनों को डिस्प्ले और अनाउंसमेंट होगा। कोच का इंटीरियर भी विशेष है। पूरे कोच को वाइलेट कलर दिया गया है।
३० फीसदी अधिक रहेगा किराया महामना श्रेणी के रैक में सफर करने का किराया सामान्य ट्रेन से ३० फीसदी अधिक है। वडोदरा से वाराणसी तक महामना एक्सप्रेस में स्लीपर क्लास का किराया ७२० रुपए है। जबकि इसी रूट पर सामान्य एक्सप्रेस ट्रेन में स्लीपर किराया ५५० रुपए है। ३० फीसदी अधिक। संभावना है कि महाकाल एक्सप्रेस का किराया भी सामान्य ट्रेन २५ से ३० फीसदी अधिक रहेगा।
बोर्ड ने दिए तीन हॉल्ट रेलवे बोर्ड ने महाकाल एक्सप्रेस को इंदौर से वरावल स्टेशन के बीच तीन हाल्ट ही दिए हैं। यानी कि ट्रेन इंदौर से चलकर सीधे गोदरा, अहमदाबाद, राजकोट में ही रूकेगी। इसके बाद सीधे वरावल स्टेशन पहुंचेगी। हालांकि अब पश्चिम रेलवे जोन देवास, उज्जैन, रतलाम, आणंद आदि स्टेशनों को भी हॉल्ट स्टेशनों की सूची में जोड़ रही है।