शुभम के बड़े भाई अरुण कुमार प्रजापति ने आरोप लगाया है कि उनके चाचा गायत्री प्रजापति पर झूठे मुकदमे लादे जा रहे हैं और शुभम की हत्या के पीछे भी उनके राजनीतिक विरोधियों का हाथ होने की पूरी संभावना है। हालांकि किसी का नाम लेकर आरोप नहीं लगाया। घटना स्थल प्रजापगढ़ जीआरपी के अंडर में आने के चलते प्रतापगढ़ जीआरपी मामले की जांच कर रही है। हत्या का आरोप लगाए जाने के बाद शव का पूरी निगरानी के साथ पोस्टमार्टम करवाया जा रहा है। शुभम गायत्री प्रजापति के सबसे छोटे भाई जगदीश प्रतापति का बेटा था।