विवि में वाम छात्र राजनीति के इतने चेहरे और चरित्र हैं कोई भी भ्रम में आ जाए। कोई खुद को एसएफआइ यानि माकपा के छात्र संगठन से जुड़ा बताता है तो कोई सीपीआईएमएल के छात्र संगठन आइसा से, कोई एसयूसी के डीएसएफ का झंडा उठाता है तो कोई माओवादी समर्थक यूएसडीएफ व रेडिकल का समर्थक है। यह सभी छात्र संगठन कभी एक होकर तो कभी अलग अलग दिखाई देते हैं।
राज्य की सत्ताधारी तृणमूल कांग्रेस का छात्र संगठन टीएमसीपी विवि में पैठ जमाने का लंबे समय से प्रयास कर रहा है लेकिन उसे अब तक आपेक्षित सफलता नहीं मिली है।
वहीं भारतीय जनता पार्टी समर्थित अखिल भारतीय विद्यार्थी परिषद ने भी जादवपुर विवि में पिछले कुछ वर्षों से सक्रियता बढ़ाई है। लेकिन उसे यहां वाम छात्र संगठन पैर पसारने की जगह नहीं दे रहे हैं।
खुफिया विभाग से जुड़े रहे एक सेवानिवृत्त अधिकारी के मुताबिक विवि अर्बन नक्सलों का गढ़ है। यहां के कई वरिष्ठ शिक्षकों के चरम वामपंथियों से संपर्क रखने और उनकी विचारधारा को प्रोत्साहित करने की सूचना एजेंसियों को मिलती रहती है। राज्य के कई हिंसक आंदोलनों से विवि के पूर्व छात्रों के जुड़े होने की सूचना भी सामने आ चुकी है।
वर्ष 2010- विवि की पूर्व छात्रा देवलीना चक्रवर्ती के विवि कैम्पस में पत्रकार वार्ता करने पर जोरदार विवाद। उसपर यूएपीए का मामला चल रहा था।
अगस्त 2013- विवि की पूर्व छात्रा जोइता दास को माओवादियों से संपर्क होने के संदेह में गिरफ्तार किया गया
सितम्बर 2014- विवि में होक कलरब नाम का बड़ा आंदोलन हुआ। उस समय भी आंदोलन के नेपथ्य में चरम वामपंथियों का नाम सामने आया।
फरवरी 2016 – चरम वामपंथी व माओवादी समर्थक छात्र संगठन के सदस्यों ने रैली निकाली, भारत विरोधी नारे लगाए।
मई 2016- विवि में फिल्म निर्देशक विवेक अग्रिहोत्री की फिल्म बुद्धा इन ए ट्राफिक जाम के प्रदर्शन को लेकर हंगामा, अग्रिहोत्री का घेराव। फिल्म की पृष्ठभूमि अर्बन नक्सलवाद थी।
मार्च 2018 – श्यामा प्रसाद मुखर्जी की प्रतिमा में तोडफ़ोड़, रेडिकल के कई समर्थक गिरफ्तार। मुख्यमंत्री जता चुकी है गुस्सा
राज्य के पूर्व राज्यपाल केशरीनाथ त्रिपाठी ने विवि में हुए हिंसक विरोध के बाद कहा था कि जादवपुर विवि गड़बडिय़ों का केन्द्र बनता जा रहा है।
वहीं मुख्यमंत्री ममता बनर्जी ने कहा था कि यदि शिष्टाचार और सौजन्यबोध में कमी है तो इसका मतलब यह है शिक्षा में चूक है। शिक्षा का उद्देश्य ज्ञान प्राप्ति होना चाहिए।
तृणमूल कांग्रेस नेता व ममता बनर्जी के भतीजे अभिषेक बनर्जी वर्ष 2014 में विवि के छात्र छात्राओं को नशेड़ी कहा था। उनके मुताबिक शराब, गांजा, चरस पर कार्रवाई से वहां आंदोलन किया गया था।
कई मौकों पर भाजपा नेताओ ंने जादवपुर को देशविरोधी तत्वों का केन्द्र बताया है। वहीं उसका छात्र संगठन अभाविप वामपंथी छात्र संगठनों पर लोकतंत्र की हत्या करने का आरोप लगाता रहता है।
विवि से जुड़े विवादों की फेहरिश्त भली ही लंबी हो लेकिन यहां का अकादमिक प्रदर्शन राष्ट्रीय स्तर पर है। विवि को वर्ष 2018 में ओवरऑल 6ठीं रैंकिंग मिली थी। वहीं वैश्विक स्तर पर दी जाने वाली क्यू एस रैकिंग में विवि का स्थान 601 से 650 के बीच व ब्रिक्स देशों की रैकिंग में 74वें पायदान पर है।