पांडुलिपियां वेद, कर्मकांड, वेदांत, सांख्य योग, धर्मशास्त्र , पुराणेतिहास, ज्यो्तिष, मीमांसा, न्यानय वैशेषिक, साहित्यप-व्याककरण तथा आयुर्वेद विषयों से संबंधित हैं। हैंड मेड कागज के अलावा भोजपत्र, लाक्षपत्र, काष्ठ् पत्र और शिला पत्र पर पांडुलिपि प्राचीन देवनागरी, बांग्लौ, उडि़या, मैथिली, गुरुमुखि, शारदा, अरबी-फारसी लिपी में लिखी हैं।