उधर, सहायक प्रोफेसर दीपक कुमार अरोड़ा ने आइआइटी डायरेक्टर अविनाश कुमार अग्रवाल व अन्य के खिलाफ बंधक बनाने व राजकार्य में बाधा डालने और मारपीट करने की परस्पर विरोधी एफआइआर दर्ज कराई। आरोप है कि डायरेक्टर व ऑफिस के अन्य कर्मचारियों ने उसे बंधक बनाया। राजकार्य में बाधा उत्पन्न करने के साथ ही मारपीट भी की।