दुर्गा मंदिर काशी के प्राचीन मंदिरों में से एक है। मंदिर का उल्लेख 'काशी खंड' में भी किया गया है। इस मंदिर में माता दुर्गा यंत्र के रूप में विराजमान हैं। मंदिर के निकट ही बाबा भैरोनाथ, लक्ष्मीजी, सरस्वतीजी, और माता काली की मूर्तियां अलग से मंदिरों में स्थापित हैं। ऐसी भी मान्यता है कि ये देवी का आदि मंदिर है, इसके अतिरिक्त वाराणसी में केवल दो ही मंदिर काशी विश्र्वनाथ और मां अन्नपूर्णा मंदिर ही प्राचीनतम हैं।