इस धमकी के चलते उनको उस स्कूल से निकाल लिया गया और उसके बाद उनका एडमिशन नैनीताल के St Joseph's College में कराया गया, जिसके बाद उनका पढ़ने में मन नहीं लगा. इसी दिक्कत को देखते हुए 17 साल की उम्र में उन्होंने स्कूल से निकाल दिया गया. दरअसल, बताया जाता है कि साल 1980 में वो हॉस्टल से बिना बचाए भाग कर फिल्म देखने चले गए थे, लेकिन पकड़े जाने के बाद उनको स्कूल से निकाल दिया गया. इसके बाद ललित 1983 से 1986 तक यूनाइटेड स्टेट की Pace University और Duke University में रहे. ललित मोदी ने वहां इलेक्ट्रिकल इंजीनियरिंग और बिजनेस एड्मिनिस्ट्रेशन पढ़ने आगे थे, लेकिन उन्होंने वो दोनों डिग्रियां भी पूरी नहीं कीं.