उधर, भाजपा ने आयोग को सौंपी गई शिकायत में उद्योगपतियों से संबंधित एनपीए को लेकर सफाई दी है, वहीं एनपीए के संबंध में पीएम का दखल नहीं होने और बायतू में आयोजित सभा में लगाए गए आरोपों के भ्रामक होने की बात भी कही है। भाजपा की ओर से केन्द्रीय मंत्री मनसुख मांडविया, राधामोहन दास अग्रवाल व ओम पाठक ने आयोग को यह शिकायत दी।