वर्ष 2002 तक महर्षि दयानंद सरस्वती विश्वविद्यालय के क्षेत्राधिकार प्रदेश में सर्वाधिक जिले थे। यह विश्वविद्यालय बीकानेर , कोटा , बारां, जोधपुर , श्रीगंगानगर, जालोर, सिरोही, पाली, बाड़मेर सहित अन्य जिलों के कॉलेज में परीक्षाएं कराता था। वर्ष-2003 में बीकानेर और कोटा विश्वविद्यालय बनते ही इसका क्षेत्राधिकार कम हो गया। चार वर्ष पूर्व जयनारायण विश्वविद्यालय को जोधपुर, पाली, जालोर, सिरोही और अन्य जिलों के कॉलेज सौंप दिए गए। महर्षि दयानंद सरस्वती विश्वविद्यालय के पास अजमेर, टोंक, भीलवाड़ा और नागौर जिले के कॉलेज रह गए हैं।