भारत सरकार के कौशल विकास कार्यक्रम के तहत सीएसआईआर की एकीकृत कौशल पहल के रूप में संस्थान कौशल विकास में कई तरह के प्रमाणपत्र पाठ्यक्रम संचालित कर रहा है जिनमें उन्नत स्पेक्ट्रोस्कोपिक तकनीकों (एनएमआर, मास, यूवी/आईआर) में कौशल विकास, माइक्रोस्कोपी (इलेक्ट्रॉन, कॉन्फोकल एवं इंट्रावाइटल माइक्रोस्कोपी) और फ्लो साइटोमेट्री में कौशल विकास, प्रयोगशाला जंतुओं की देखभाल एवं प्रबंधन तथा प्रायोगिक तकनीकों में कौशल विकास, ड्रग डिजाइन एंड डेवलपमेंट के लिए कम्प्यूटेशनल दृष्टिकोण के लिए कौशल विकास जैसे कई पाठ्यक्रम प्रमुख हैं।